短注意RNA剪接因子和RNA-Directed DNA甲基化

文摘

RNA-Directed组蛋白和另外的DNA改变是表观遗传的基础监测仪器记录从酵母和植物温暖混合动物。heterochromation形成在酵母RNA -说情导演淡化系统,而DNA甲基化在植物的基础是通过RNA-coordinated DNA甲基化(RdDM)通路。最近,嫁接因素占有关与RNAi-coordinated异染色质安排在酵母和植物RdDM通路。在酵母中,嫁接变量可能会给一个舞台与核时代通过与RDRC因此影响异染色质合作开发,而在植物,不同的连接因素似乎在RdDM通路改变的步伐。

关键字

DNA甲基化;异染色质的形成;核;表观遗传调控

介绍

胞嘧啶在真核生物DNA甲基化是不可避免的,假设基本部分在各种自然周期包括晋升、转座子和其他DNA的消声做了重复的工作,x染色体失活的生物进化,和基因组雕刻。在温血动物,几乎25%的甲基胞核嘧啶发生在non-CG设置(mCHG和mCHH H = A, C或T)在早期阶段基本微生物,在接近100%的methylcytosines CG设置在胎儿成纤维细胞等细胞分离和70%左右的-80% CG二核苷酸是所有通过基因组甲基化。另一方面,在植物中,胞嘧啶甲基化在非- CG设置可以到达一个喜欢水平,CHG 23%和22%在青春的花朵CHH设置组织。在模式植物拟南芥大人离开,另外有很大程度的DNA甲基化在非- CG设置,CHG CG的24%,6.7%和1.7%的CHH基因组中甲基化。不像脊椎动物的整个基因组DNA甲基化可用,有植物包含DNA甲基化在转座子主导,其他复发,着丝粒区。

RNA剪接因子

在脊椎动物中,DNA甲基化是由DNA甲基转移酶催化(DNMTs)。DNMT1是负责跟上对称CG甲基化,重新和种能阻碍DNMT3B DNMT3A和负责DNA甲基化(1]。植物中,支持对称CG甲基化是由DNA甲基转移酶1 (MET1)催化化学、DNMT1的直接同源;对称CHG甲基化是由plant-explicit DNA甲基转移酶,跟上CHROMOMETHYLASE 3人行CHH甲基化由域重新跟上甲基转移酶2 (DRM2)、一种能阻碍DNMT3B同族体DNMT3A /。再一次DNA甲基化在植物是由小干扰rna (siRNAs)通路称为RNA-coordinated DNA甲基化(RdDM)和DRM2催化剂预计再一次甲基化和催化胞嘧啶甲基化的三个连续设置(2]。

在RdDM通路,两个plant-explicit RNA聚合酶,波尔IV和V波尔,。波尔IV和V波尔示范在这个途径的各种进步,与波尔四世被预期24-nucleotide (nt)核生物起源和波尔V工作作为DNA甲基化的下游效应。的帮助下SNF2-like假定的染色质重建蛋白质CLSY1 homeodomain记录因子DTF1 / SHH1,与波尔IV,波尔IV是注册来解释转座子和重复位点3]。随后记录复制到双链RNA(极)依赖RNA的RNA POLYMERASE2 (RDR2)然后处理成24-nt核工器DICER-LIKE 3 (DCL3)。

结论

因此,RNA甲基化酶HEN1混入甲醇的siRNAs 3安全与后来的一个链'ends siRNAs堆叠成AGO4。波尔V提供初始记录招收siRNA-bound AGO4,通过基地-核之间的配对和开始记录。稳定关系的AGO4波尔V纪录同样依赖其通信的最大单元NRPE1波尔V和KTF1, Spt5同族体酵母记录延长因素。一个名为DDR的假定的chromatin-renovating复杂,由DRD1, DMS3 RDM1蛋白质,预计为波尔与染色质和波尔V V关系记录。RDM1蛋白质之间的关系与AGO4 DDR复杂,DRM2可能协助招收DRM2波尔V-target催化DNA甲基化的地区。

引用

1. 黑格D。基因组印记和人类亲缘关系的进化心理学。《美国国家科学院刊。2011;108:10878 - 10885。
2. 陈T, et al。真核生物DNA甲基转移酶的结构和功能。咕咕叫Dev杂志。2004;60:55 - 89。
3. Saze H,等。维护CpG甲基化是表观遗传继承植物配子形成过程中所必需的。Nat麝猫。2003;34:65 - 69。